但中国的二次元行业仍处于发展的初期，仍存在诸多限制因素：

　　1. 二次元用户群体依旧属于小众群体。虽然二次元的用户群体规模正在逐年增长，正从小众逐渐走向大众，但与中国的网民规模相比，二次元用户群体仍属于小众群体。据CNNIC发布的《第36次中国互联网络发展状况统计报告》数据显示，截至2015年6月，我国网民规模已达到6.68亿，而泛二次元用户规模仅为 1亿人左右。业内人士也表示，并不认为二次元用户会成为主流。此外，虽说二次元用户群体的年龄向上和向下有所延展，但二次元群体年龄层次处在16—24岁之间的超过总数的75%。

　　2. 二次元行业的商业模式尚未成熟。虽然，目前二次元行业已经收获了部分忠实用户，但却一直没有清晰的盈利模式。以弹幕视频网站为例，日本的弹幕网站是采用付费会员制的方式，用户每月支付一定金额便可在网站上随意观看，但对于中国来说，用户还没有养成付费的习惯，企业主要依靠将广告、发型周边产品、IP衍生及授权等方式来实现变现。二次元行业仍处于发展初期，商业模式尚未成熟。

　　3. 二次元优质作品少，版权纠纷争议多。在我国二次元文化仍是一种亚文化，大众认可度低，虽然随着国家政策扶持力度的加大，我国动漫作品数量直线上升，但却缺乏具有内容影响力的精品，同时，限制国外动漫作品的引进，也阻碍了二次元文化的多元化发展。此外，二次元文化的发展经常与版权纠纷相关联，其中以 AcFun、Bilibili为例：A站曾因侵权盗链，遭到优酷起诉，并要求赔偿1800万；B站也因版权问题遭到了爱奇艺、斗鱼网络科技以及华视网聚等多家公司的起诉。